由於現代醫學的進步，各種新的儀器及治療方法均日新月異，而本院為醫學中心，為了維持高品質的醫療服務及提升本院醫療水準，傳承傳統中醫經驗，輔助及整合現代醫學之治療，因而首先創立了台灣第一個具醫學中心規模的中醫醫院。自創立至今，已在台灣及各地擁有一定的學術地位。回首過去，創科主任楊賢鴻醫師帶領大家走過草創時期那些艱難的日子。爾後，經歷吳宜鴻主任、郭忠禎主任、陳俊良主任、江昆壕主任、林意旋主任至目前的許珮毓主任，持續積極地推展臨床服務、教學及研究。

經過此二三十年來的努力，雖然有內科及兒科的合併，但完善的訓練制度已有眾多的住院醫師經過完整的西醫內兒科訓練且回到中醫內兒科繼續投入各專科領域，使得本科的陣容更形堅強；因此不論是在臨床的服務及學校教育的養成都能有學有專精的醫師足以提供。本科著重於專科專病的發展與西醫的跨領域合作。除了臨床服務，本科也積極鼓勵醫師加強論文之寫作，各種相關研究；提出各種研究報告，足以讓本科除能符合醫學中心的精神，也期待未來能對中醫學的進步有所貢獻。